健康小屋管理制度主要包括以下几个方面：

一、服务流程管理

1. 预约环节：居民可以通过电话、网络等方式进行预约。
2. 登记环节：居民到达健康小屋后，应当进行登记，包括个人信息、病史等信息。
3. 检查环节：在医生的指导下，进行各类健康检查。
4. 诊疗环节：根据检查结果，医生进行诊疗，并开具处方。
5. 健康管理环节：对于慢性病患者，进行健康管理，制定个性化的健康管理方案。

二、服务质量与效率管理

1. 服务应当及时、高效，避免让居民等待过久。
2. 服务应当符合医疗、公共卫生等相关法律法规的要求，保证服务质量。

三、服务评价管理

1. 健康小屋的服务应当采取居民满意度评价的方式进行评价，评价结果应当及时公布，并采取措施改进服务质量。
2. 管理机构应当加强对服务质量的监督和管理，确保服务质量。

四、保密制度管理

      健康小屋应当制定保密制度，保护居民的隐私和个人信息安全。

五、设备管理

1. 健康小屋内应在所有仪器设备旁的醒目位置标注使用说明和注意事项。
2. 工作人员要在每天下班之前，对小屋的仪器进行清洁整理，定期清点体检设备，确保设备的准确性。
3. 每天产生的医疗废物，要按照《医疗废物管理办法》的规定收集、转运和最终处置，禁止与生活垃圾混放。

六、开放时间管理

1. 小屋开放时间原则上每年不少于250天，要切实发挥小屋的作用。
2. 健康小屋要保证工作日免费对外开放。

七、人员与培训管理

1. 健康小屋应明确责任部门和责任人，并与健康咨询师或自助健康检测指导人员一起纳入所在社区卫生服务中心或其他卫生行政部门指定机构管理，建立日常考核机制，“健康小屋”的管理运作情况纳入年度目标考核。
2. 健康咨询师或自助健康检测指导人员每年要参加所在社区卫生服务中心或其他卫生行政部门指定机构组织的专业技术培训。
3. 小屋内要有专门的工作人员，工作人员需要是医疗相关专业，能随时解答居民提出的健康疑问。

八、监督与考核管理

1. 各市（州）卫生局负责本地区健康小屋的规划布局及监督管理。要建立定期考核制度，把健康小屋的建设、运行、管理情况纳入综合目标管理考核，确保健康小屋建设的健康有序推进和可持续发展。
2. 社区卫生服务中心要建立健康小屋管理制度、工作流程、操作规范、应急预案等规章制度，实施规范化、制度化管理。
3. 社区卫生服务中心要与社区居委会建立联系，加强健康小屋的宣传工作，通过宣传栏等方式，向居民广泛宣传健康小屋的作用和意义，营造良好的工作氛围。
4. 健康小屋为辖区居民提供的体检项目全部免费，成本由财务预算列支或由基本公共卫生服务相应项目经费支出。

以上信息仅供参考，具体管理制度可能因地区和机构而有所不同。